Le but du stage sera de développer un algorithme de segmentation de la moelle épinière humaine sur des images IRM.
La première étape est la détection d'une sous image contenant la moelle. Pour cela, on utilisera des méthodes d'apprentissage de type SVM à partir de descripteur de forme de chaque sous image. La méthode devra être robuste aux variations de forme de la moelle et à la modalité IRM utilisé (T2, T2*, diffusion...).
La seconde étape sera la segmentation de la moelle et si la modalité le permet la segmentation matère grise / matière blanche. Pour cela, on utilisera des méthodes de type "level set" en se basant sur les contraste de l'image.
Compétences demandées:
- Bon niveau en mathématiques ainsi qu'en programmation (matlab, bash, c++, ...)
- Connaissances en traitement d'image
- Idéalement, connaissances en apprentissage machine, descripteur locaux (SIFT, HOG, GLOH, ...) et méthodes levelset
Lieu: laboratoire CREATIS, campus de la Doua, Villeurbanne
Durée: 6 mois
Début du stage : 2015
Rémunération: 436€/mois