[Dcmlib] RE: [Fwd: Re: CSI protocol (off topic)]

[Olivier Stern]

En fait pour ce qui est de la lecture des données proprement dites, j ai un
petit programme venant de chez siemens (ou étudiants travaillant pour
siemens) qui m ouvre les différents voxels et je vois apparaître le signal.
Apres plusieurs traitements appliqués grâce à des fichiers de chez siemens
intégrés par le programme, j obtiens une analyse des pics relativement
bonne.

Ce qui m'intéressait de connaître surtout c est la représentation des ces
voxels dans l espace pour pouvoir recaler l information correctement sur les
IRM. Lorsque l'on ouvre le fichier CSI avec un éditeur de texte classique,
on peut voir dans le début une série de champs "textes". Dedans on peut y
retrouver le nombre de voxel (selon les deux axes), la position du centre de
la coupe ainsi que son épaisseur, sa largeur et sa longueur. Connaissant ça
et sachant que les voxels ont tous la même taille, je devrais avoir toutes
les informations de la coupe elle-même. La deuxième chose est que l'image de
spectro est faite en même temps que l'irm sur lequel il est superposé dans
les machines médicales, donc même orientation. Je pense donc que je devrais
(mais je parle toujours au conditionnel) arriver à recaler correctement les
deux images en cherchant tout d abord à situer le centre de la coupe puis en
tracant autour. Une question me turlupine tout de même: les images ayant la
même orientation, faut il "normaliser" avant de parcourir l image ou non ?

Qu'est ce qu'une spectral map exactement ? Ce qui fait correspondre un voxel
(un élément de la matrice je présume ?) à l'image anatomique actuellement
créée chez siemens et plaquée sur les irms ? C est justement pour ne plus
avoir ce genre d'images que je travaille. Le médecin qui me supervise
voudrait avoir une image irm qui en plus de l information anatomique de
référence (T1 ou T2) a également l'information spectro fusionnée (et non
plaquée) dessus. C'est pourquoi j'ai cherché à passer d'image monochrome en
rgb. 

Merci,
   Olivier

-----Message d'origine-----
De : Mathieu Malaterre [mailto:mathieu.malaterre at kitware.com] 
Envoyé : mercredi 29 juin 2005 16:26
À : Olivier Stern
Cc : dcmlib at creatis.insa-lyon.fr
Objet : Re: [Dcmlib] RE: [Fwd: Re: CSI protocol (off topic)]

Olivier,

	Finalement t'es arrive a lire ces images ? Apres une petite
recherche 
sur google ces images sont definis en 'Spectral Matrices' et il faut une 
'Spectral Map' pour passer de la matrice a une image anatomique...

	La partie chargement de la matrice doit etre relativement facile, 
ensuite c'est vrai on a besoin d'info de la part de Siemens, a moins que 
la map soit aussi dans le fichier DICOM

My 2 cents,
Mathieu


Olivier Stern wrote:
> Je trvaille sur des images siemens. CSI = Chemical Shift Imaging
> 
> -----Message d'origine-----
> De : Mathieu Malaterre [mailto:mathieu.malaterre at kitware.com] 
> Envoyé : mardi 21 juin 2005 0:25
> À : dcmlib at creatis.insa-lyon.fr
> Cc : olivier.stern at swing.be
> Objet : [Fwd: Re: CSI protocol (off topic)]
> 
> Ok je comprends plus, CSI c'est siemens ou c'est GE ?
> 
> 
> -------- Original Message --------
> Subject: Re: CSI protocol (off topic)
> Date: 20 Jun 2005 14:39:48 -0700
> From: eric.goodall
> Organization: http://groups.google.com
> Newsgroups: comp.protocols.dicom
> References: <>
> 
> Never heard of "CSI Protocol" in relationship with ECG/EKG or anything
> else for that matter. However,  there is a company call Criticare
> Systems Inc (CSI) which makes vital signs monitors, include multi-lead
> ECG monitors. They are coincidentally located in Waukesha WI, just down
> the road "a piece" from the big GEMS plant. It is entirely possible
> they may OEM their equipment to GE. Suggest you might contact the
> company to determine whether they are in fact the manufacture of the
> system you're looking at and whether they might have some technical
> specifications on their equipment outputs. URL is
> http://www.csiusa.com/
> 
> 
> 
> _______________________________________________
> Dcmlib mailing list
> Dcmlib at creatis.insa-lyon.fr
> http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/dcmlib
>