2017

Robustness of spatio-temporal regularization in perfusion MRI deconvolution: An application to acute ischemic stroke   M. Giacalone, C. Frindel, M. Robini, F. Cervenansky, E. Grenier and D. Rousseau   Magnetic Resonance in Medicine   26 December 2016   DOI: 10.1002/mrm.26573   2017.

Diffusion Tensor Imaging Tractography Detecting Isolated Oculomotor Nerve Damage After Traumatic Brain Injury   T. Jacquesson, C. Frindel, F. Cotton   World Neurosurgery, vol. 100, pp. 707.e5-707.e7   2017.

Multicomponent and Longitudinal Imaging Seen as a Communication Channel—An Application to Stroke   M. Giacalone, C. Frindel, E. Grenier, D. Rousseau   Entropy, vol. 19, no. 5, pp. 187   2017.

Suite logicielle pour l'imagerie de perfusion dans l'étude de l'accident vasculaire cérébrale   M. Giacalone, C. Angel, C. Frindel, F. Cervenansky, M. Robini, T.-H. Cho, Y. Berthezène, N. Nighoghossian, D. Rousseau   In Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS), Lyon, France   Mars, 2017.

Evaluation de méthodes de quantification de la perfusion cardiaque: approches bayésiennes et spatio-temporelles   C. Daviller, M. Giacalone, C. Frindel, T. Boutelier, P. Croisille, M. Viallon   In Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS), Lyon, France   Mars, 2017.

Système de surveillance à distance de la démarche humaine dans le cadre des maladies neurologiques   L. Lalanne, P. Gard, D. Rousseau, F. Lesueur, C. Frindel   In Recherche en Imagerie et Technologies pour la Santé (RITS), Lyon, France   Mars, 2017.

2016

An Unsupervised Spatio-Temporal Regularization for Perfusion MRI Deconvolution in Acute Stroke.   M. Giacalone, C. Frindel and D. Rousseau.   In 24th European Signal Processing Conference (EUSIPCO), Budapest, Hungary   September, 2016.

Machine learning applied to soil-root segmentation in X-ray computed tomography.   C. Douarre, R. Schielein, C. Frindel, S. Gerth and D. Rousseau. &nbsb In 5th International Workshop on Image analysis methods for the plant sciences, Angers, France   September, 2016.

Scale analysis in 2D projections of 3D root systems.   C. Douarre, C. Frindel and D. Rousseau.   In 5th International Workshop on Image analysis methods for the plant sciences, Angers, France   September, 2016.

Comparison of propagation-based phase contrast tomography and full-field optical coherence tomography on bone tissue.   S. Di Tommaso, H. Rositi, M. Langer, C. Frindel, C. Olivier, F. Peyrin, D. Rousseau.   In 16th European Microscopy Conference, Lyon, France   September, 2016.

3D Image Analysis of high resolution confocal microscopy data of Drosophila Melanogaster brain.   C. Murtin, C. Frindel, D. Rousseau and K. Ito.   In Journée GDR-ISIS "Traitement du signal et des images pour la biologie", Paris, France   June, 2016.

Interest of Non-Negativity Constraint in Perfusion DSC-MRI Deconvolution for Acute Stroke.   M. Giacalone, C. Frindel, M. Robini and D. Rousseau.   In 23 rd IEEE International Conference on Systems, Signals and Image Processing (IWSSIP), Bratislava, Slovak Republic   May, 2016.

Multipleview image registration based on landmarks without fluorescence beads in 3D light sheet microscopy.   G. Constantino, C. Murtin, C. Frindel, C. Riviere, T. Homan, K. Ito, D. Rousseau.   First French SPIM Conference, Bordeaux, France   April, 2016.

A Sensitive and Automatic White Matter Fiber Tracts Model for Longitudinal Analysis of Diffusion Tensor Images in Multiple Sclerosis.   C. Stamile, G. Kocevar, F. Cotton, F. Durand-Dubief, S. Hannoun, C. Frindel, C. Guttmann, D. Rousseau and D. Sappey-Marinier   PloS one, vol. 11, no. 5, pp. e0156405   2016.

Global diffusion tractography by simulated annealing   M. Robini, M. Ozon, C. Frindel, F. Yang and Y. M. Zhu   IEEE Transactions on Biomedical Engineering   2016.

2015

A longitudinal model for variations detection in white matter fiber-bundles.   C. Stamile and G. Kocevar and F. Cotton and S. Hannoun and F. Durand-Dubief and C. Frindel and D. Rousseau and D. Sappey-Marinier.   In International Conference on Systems, Signals and Image Processing (IWSSIP), London, UK   September, 2015.

Simulations numériques en IRM de perfusion cérébrale : bruit log-ricien ou bruit gaussien ?   M. Giacalone, C. Frindel, M. Robini, E. Grenier and D. Rousseau.   In XXV e GRETSI, Lyon, France   September, 2015.

A Random Forest Based Method for classification of White Matter Fiber-Bundles in Multiple Sclerosis.   C. Stamile , G. Kocevar , S. Hannoun , C. Frindel , F. Cotton , F. Durand-Dubief , D. Rousseau.   In XXV e GRETSI, Lyon, France   September, 2015.

Analyse en échelles pour l’optimisation du paramètre de reconstruction en tomographie X de phase ; application à l’imagerie du cerveau du petit animal.   H. Rositi, C. Frindel, M. Wiart, C. Olivier, F. Peyrin and D. Rousseau.   In XXV e GRETSI, Lyon, France   September, 2015.

Detection of Longitudinal DTI Changes in Multiple Sclerosis Patients Based on Sensitive WM Fiber Modeling.   C. Stamile, G. Kocevar, F. Cotton, F. Durand Dubief, S. Hannoun, D. Rousseau, C. Frindel, D. Sappey-Marinier.   In International Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology (ISMRM),Toronto, CA   June, 2015.

Multiple Sclerosis Clinical Classification Based on DTI Fiber Analysis.   C. Stamile, G. Kocevar, F. Durand Dubief, F. Cotton, S. Hannoun, C. Frindel, D. Sappey-Marinier.   In International Society for Magnetic Resonance in Medecine and Biology (ISMRM),Toronto, CA   June, 2015.

Fast virtual histology of unstained mouse brains using in-line X-ray phase tomography.   H. Rositi, V. Desestret, F. Chauveau, T. H. Cho, E. Ong, L. P. Berner, L. Weber, M. Langer, C. Olivier, C. Frindel, N. Nighoghossian, Y. Berthezène, F. Peyrin, D. Rousseau and M. Wiart.   In 10 th European Molecular Imaging Meeting, Tübingen, Germany   March, 2015.

Validity of Shape as a Predictive Biomarker of Final Infarct Volume in Acute Ischemic Stroke.   C. Frindel, A. Rouanet, M. Giacalone, T. H. Cho, L. Østergaard, J. Fiehler, S. Pedraza, J. C. Baron, M. Wiart, Y. Berthezène, et al.   Stroke.  2015.

2014

Computer vision tools to optimize reconstruction parameters in x-ray in-line phase tomography.   H. Rositi, C. Frindel, M. Wiart, M. Langer, C. Olivier, F. Peyrin and D. Rousseau .   Phys Med Biol, vol. 59, pp. 7767-7775.  2014.

Découverte du logiciel graphique KNIME pour la mise en place de pipelines d’analyse d'images.   C. Frindel, D. Rousseau.   Ecole Thématique Interdisciplinaire du CNRS : Microscopie Fonctionnelle en Biologie (MiFoBio), Seignosse, France   4-10 Octobre, 2014.

Modules d'initiation au traitement numérique des images pour des élèves ingénieurs «informaticiens» : un retour d'expérience dans deux contextes différents.   C. Frindel, D. Rousseau.   11ième Colloque Enseignement des Technologies et des Sciences de l'Information et des Systèmes (CETSIS), Besançon, France.   Octobre, 2014.

Low cost biospeckle imaging applied in plant sciences.   C. Caredda, D. Rousseau, Y. Morille, C. Frindel, E. Belin, F. Chapeau-Blondeau, D. Gindre.   International Workshop on Image Analysis Methods for the Plant Sciences, Aberystwyst, UK, September, 2014.

Image Registration for Confocal Fluorescence Microscopy 3-Dimensional Stack of Images of Drosophila Melanogaster Central Nervous System.   C. Murtin, C. Frindel, D. Rousseau, and K. Ito.   In 11th International Congress of Neuroethology (ICN), Sapporo, Japon.   August, 2014.

Tomographie de phase par rayonnement synchrotron appliquée à la détection de nanoparticules dans le cerveau.   H. Rositi , C. Frindel, M. Langer, M. Wiart, C. Olivier, F. Peyrin, D. Rousseau.   In Journées d'imagerie optique non conventionnelle - 9e édition, Paris, France.   Mars, 2014.

A 3-D Spatio-Temporal Deconvolution Approach for MR Perfusion in the Brain.   C. Frindel, D. Rousseau and M. Robini.   Med Image Anal, vol. 18, no. 1, pp. 144-160.   2014.

2013

Information-based analysis of X-ray in-line phase tomography with application to the detection of iron oxide nanoparticles in the brain.   H. Rositi , C. Frindel, M. Langer, M. Wiart, C. Olivier, F. Peyrin, D. Rousseau.   Optics Express, vol. 21, no. 22, pp. 27185-27196.   2013.

Comparison of different normalization strategies in cerebral perfusion MRI.   H. Daudet, A. Collomb, D. Rousseau, F. Chauveau, M. Wiart, Y. Berthezène, N. Nighoghossian, C. Frindel.   In Proc. Eur. Soc. Mag. Reson. Med. 30, Toulouse, France.   October, 2013.

Shape descriptors to characterize the evolution of cerebral ischemic lesions in longitudinal follow up with perfusion weighted MRI.   A. Rouanet, C. Frindel, F. Denis, F. Dupont, M. Wiart, T. Ritzenthaler, Y. Berthezène, N. Nighoghossian, D. Rousseau.   In Proc. Eur. Soc. Mag. Reson. Med. 30, Toulouse, France.   October, 2013.

Toward Temporal Fiber.   M. Ozon, M. Robini, P. Croisille, C. Frindel, Y.-M. Zhu.   In Computing in Cardiology, Zaragoza, Spain, pp. 567-570.   September, 2013.

Approche 3D spatio-temporelle pour la déconvolution en imagerie de perfusion du cerveau.   C. Frindel, D. Rousseau and M. Robini.   In GRETSI '13 : 24ème colloque GRETSI sur le Traitement du Signal et des Images, Brest, France.   September, 2013.

Corrélations entre maillages 3D au moyen du logiciel R : application à l’imagerie par IRM de l'accident vasculaire cérébral.   A. Rouanet, C. Frindel and D. Rousseau.   In Deuxièmes rencontres R, Lyon, France.   June, 2013.

Démonstrateur en imagerie à vocation diagnostique dans le cadre de l’AVC.   C. Frindel, H. Rositi, M. Sdika, F. Chauveau, T.-H. Cho, B. Neyran, D. Rousseay, M. Wiart, Y. Berthezène and N. Nighoghossian.   In Journée Démonstrateurs 2013, Angers, France.   June, 2013.

Décloisonnement disciplinaire et mise en situation par projet : expérience d'une semaine en immersion autour de la découverte pluridisciplinaire de la loi des gaz parfaits.   V. Eglin, M. Perez, S. Casanova, C. Frindel, D. Jacques, Y. Ricotti, M. Vives, A. Toumine, L. Jarrier.   In 3ème colloque pédagogie et formation du groupe INSA, Strasbourg, France.   April, 2013.

Synchrotron radiation micro-CT imaging of the mouse brain.   A. Chabrol, H. Rositi, M. Marinescu, M. Langer, C. Olivier, F. Peyrin, C. Frindel, M. Wiart, and Y. Berthezène.   In ECR 2013, Vienna, Austria.   March, 2013.

2012

Scale analysis of multicomponent MRI histograms.   C. Frindel, D. Rousseau, S. Hannoun, F. Durand-Dubief, F. Cotton, and D. Sappey-Marinier   In Journées scientifiques conjointes aux GDR - Imagerie du vivant, Lyon, France.   December, 2012.

Scale analysis of multicomponent biomedical images with ImageJ software.   C. Frindel, D. Rousseau, D. Ressnikoff, F. Chapeau-Blondeau, Y. Tourneur.   In ImageJ Conference 2012, Luxembourg, Luxembourg.   October, 2012.

Synchrotron Radiation Micro-Computed Tomography Imaging of the mouse brain.   A. Chabrol, H. Rositi, M. Marinescu, F. Peyrin, C. Olivier, M. Langer, C. Frindel, M. Wiart, Y. Berthezène.   In AFH 2012- Association française d'histopathologie, Lyon, France.   June, 2012.

Computer vision tools for the quantification of iron oxide nanoparticles in the brain.   C. Frindel, D. Rousseau, M. Wiart.   In TOPIM 2012- Image Processing and Analysis, Les Houches, France.   April, 2012.

Application d'une mesure de similarité locale pour la segmentation du système ventriculaire cérébral en IRM de perfusion.   C. Frindel, D. Rousseau, T.-H. Cho, Y. Berthezène, M. Wiart, N. Nighoghossian.   In SFRMBM 2012- Application IRM homme , Marseille, France.   Mars, 2012.