Détection et segmentation de bactériocytes dans des images histologiques par miscroscopie optique

La microscopie optique utilisée en histologie permet l’étude des tissus biologiques et plus particuliè- rement d’explorer la structure des organismes vivants et les rapports constitutifs entre leurs éléments fonctionnels.

Un bactériocyte est une cellule eucaryote spécialisée que l’on trouve chez le puceron. Ces cellules contiennent des bactéries endosymbiotiques qui fournissent des acides aminés essentiels et métabolites à leur hôte (le puceron). Les bactériocytes ainsi que leurs symbiotes sont transmis verticalement : les bactéries contenues dans le bactériocyte maternel sont transférées dans les embryons.

Dans le cadre de ce projet, on va en particulier s’intéresser à détecter la présence de bactériocytes qui peuvent se développer au cours de deux de quatre stades larvaires que connaît le puceron. Ces bactériocytes apparaîssent très texturés sur les images en microscopie optique (du fait de la forte densité de bactéries dans ceux-ci).

Exemples de cellules de puceron : à gauche en microscopie optique et à droite après traitement des images.

Images du laboratoire BF2I : équipe de Federica Calevro
Etudiants : Maguelonne Roux, Florian Arnoux et Armel Thöni.