[Vv] Question

[Thomas BAUDIER]

Bonjour Grégory,

On est ravi d'accueillir de nouveaux utilisateurs de vv !
A ma connaissance, nous n'avons jamais rencontré ce problème. Par contre 
j'ai peut-être quelques pistes qui peuvent expliquer que le nez ne soit 
pas dirigé dans la direction attendue.

J'ai lu que vous allez utiliser le logiciel en neurologie. Un premier 
point est que le système de coordonnées utilisé par vv est celui d'ITK, 
ie. LPS (Left/Posterior/Superior) et non RAS (Right/Anterior/Superior) 
comme en neuro si je ne me trompe pas.

Il y a 2 autres points qui peuvent expliquer ce changement de direction:
  - la présence d'une matrice de rotation. Elle est visible en bas à 
gauche dans l'interface de vv ou alors dans le tag dicom (0020,0037) 
ImageOrientation.
  - Le fait qu'il y ait une valeur négative dans le spacing (gestion 
hasardeuse d'ITK).

J'espère que ces quelques points permettent d'expliquer le problème. 
Sinon n'hésitez pas revenir vers nous.

Bonne journée
Thomas BAUDIER


On 2017-04-24 11:48, Grégory BAERT wrote:
> Bonjour,
> 
> Je me permets de vous contacter car je suis ingénieur en informatique
> au sein d'une unité de recherches INSERM. Utilisant notre propre
> environnement de développement pour le traitement d'images
> médicales, nous sommes à la recherche d'une autre environnement.
> J'ai trouvé sur internet votre logiciel « vv a 4D Slicer ». J'ai
> récupéré les sources, compilé avec CMake et installé sur un
> ordinateur sous Windows 7 Pro x64.
> 
> Ce futur environnement sera utilisé pour la neurologie. En testant le
> logiciel et en chargeant une de nos séries Dicom anonymisées,
> (provenant du CHRU de Lille), nous avons remarqué que le viewer Dicom
> pour la vue sagittale est à l'envers, ne correspondant pas à
> l'orientation conventionnelle
> 
> è Le nez du patient est dirigé vers la droite alors que cela devrait
> être vers la gauche.
> 
> Est-ce un « souci » que d'autres utilisateurs vous ont déjà
> remonté ?
> 
> Merci par avance,
> 
> Bien à vous,
> 
> Grégory BAERT
> 
> Ingénieur d'études - Unité INSERM 1189 (Onco-Thai)
> 
> Tél : 03.20.44.67.16
> 
> http://www.onco-thai.fr
> 
> 1, avenue Oscar Lambret
> 
> 59037 LILLE Cedex
> _______________________________________________
> vv mailing list
> vv at creatis.insa-lyon.fr
> http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv