[Dcmlib] 2D -> 3D

[Jean-Pierre ROUX]

At 16:09 +0200 16/07/05, Olivier Stern wrote:
>Bonjour,
>
>Je me demandais si il y avait une classe qui transformait une série 
>de slices en un volume 3D (si c'est réalisable) où tout du moins 
>comment faireŠ Cette question a certainement du être posée, mais en 
>survolant les archives je n'ai pas trouvé de messages correspondants.

Il n'y pas vraiment la notion de 'volume' en Dicom.
Ca peut être une 'liste' de coupes (une coupe par fichier image), ou 
alors un fichier 'Multiframes' (n coupes dans le meme fichier).
Pour 'fabriquer' en memoire un volume, il faut concatener les pixels 
des plans successifs.
Ca se fait donc 'hors de gdcm'.

> Dans un même ordre d'idée, comment affiche-t-on un volume ? Avec vtk ?



Il y a, dans gdcm, un vtkGdcmReader (classe dérivée de 
vtkImageReader) qui prend une liste de fichiers dicom, et les lit 'a 
la vtk'.

Et a ce moment, toutes les possibilités de vtk sont ouvertes.


>Je n'arrive pas à comprendre comment on peut voir l'intérieur du volume.


La maniere de le visualiser va dependre de ce qu'il contient :

S'il contient, par exemple, et pour rester dans le domaine medical, 
des waisseaux du cou en hyper signal, le MIP 'maximum intensity 
projection) irra tres bien.
Si ce sont des images de Scanner X, le MIP ne permettrait de voir que 
le crane, ce n'est probablement pas ce qu'on veut.

Et si ce sont des images d'IRM fonctionnelle, il faudra probablement 
faire de la segmentation avant, puis decider de ce qu'on veut 
visualiser, et comment.
Voir VTK

Jean-Pierre



>
>Merci,
>            Olivier
>
>
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>Dcmlib at creatis.insa-lyon.fr
>http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/dcmlib

  Jean-Pierre ROUX
  CREATIS - CNRS UMR 5515, INSERM U 630
  Laboratoire de Radiologie Experimentale
  Hopital Cardiologique
  28 Avenue du Doyen LEPINE
  B.P. Lyon-Montchat
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  URL      : http://www.creatis.univ-lyon1.fr
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