[Dcmlib] modifier le header d'une serie dicom

[Jean-Pierre Roux]

laurent.paul at club-internet.fr wrote:

>
>
>
>
[...]

> >> Bref, j'aimerais changer cette valeur dans chaque header de ma série. 

>
>
> Si gdcm ne sauve qu'en raw, je vais faire autrement car je prefererais 
> garder mon format analyze.

==> Je ne suis pas sur d'avoir tout compris, la ...
==> Ce que nous (gdcm) apelons "Raw", c'est  'non compressé' par 
opposition a des images 'Dicom Jpeg encapsulated',
==> ou encore RGB, par opposition a "Grey level + Palette color".
==> Ce n'EST PAS "RAW vs Analyse"

> Par contre, j'ai deja eu une reponse de Jean-Pierre Roux que je 
> posterai egalement sur la mailinglist. Il m'indique un log pour editer 
> les header.
> J'attends d'avoir la licence et j'essaie ca.



> >> Autre solution:
> >> J'utilise le format Analyze. Ma série est donc convertie en un fichier
> >> et un header. Je ne sais pas exactement quelle est la structure 
> mais il
> >> doit bien y avoir un tag du meme style que celui du dicom. Peut etre
> >> serait-ce plus facile de modifier seulement ce tag.
> >
> >Quoi les fichier en Analyze ont aussi le meme probleme ?
> >
>
>
> Eh oui les fichiers analyze ont ce probleme vu qu'ils ont été crées a 
> partir de mes images Dicom. Je les genere avec MRicro. Dans le header 
> généré je devrais retrouver les proprietes de mes images (par ex 512 
> taille en X et Y) mais je trouve simplement le patient ID, Start & End 
> acq. time... Ca m'interresse pas!
> Je vais me renseigner sur MRicro et la generation de fichiers header.


==>Si les images Dicom ont un pb dans l'entete, le fichier Analyse 
l'aura egalement.
==> Mias il est anormal que la taille des images (nb Lignes, nb 
Colonnes) ne figure pas dans le header Analyze.
==>(j'avais ecrit, il y a plusieurs années -mais je l'ai perdu-, un 
programme Dicom2Analyze, qui creeait le header, et extrayait les pixels; 
ces info figuraient dans le Header)
==>Dans l'hypothese ou tu trouve un 'Dicom convertor' qui fabrique des 
Haeders corrects, le + simple sera de corriger le header genere, plutot 
que de corriger *chaque* fichier Dicom

JPRx

>
>
> >Mathieu
> >Ps: comme tu utilises ITK pourquoi ne pas faire le traitement dans ITK
> >directement:
> >
> >if( image == image_avec_faux_ecart )
> > ecart = abs(ecart)
> >
> >ca evite de faire un batch sur les images original. Dans le future tu
> >peux ne pas te rappeler si tu as preprocesser les fichiers ou non...
> >
>
> C'est vrai que j'avais pas pensé a ITK. Il fait tellement de choses 
> que j'y pense pas!
> J'ai trouvé un exemlpe deja construit qui modifie une ou plusieurs 
> valeur(s) (d'apres le code source). Par contre, j'arrive pas a 
> l'utiliser. J'ai un probleme pour lui passer la clé, je n'arrive pas a 
> lui passer sous le bon format.
> Ma clé est: 0018,0088
> J'ai essayé telquel, 00180088 et meme 0x0018,0x0088 mais sans resultat.
> Je asis que tu reponds sur la mailing list de ITK, donc si tu pouvais 
> m'aider en passant ce serait sympa.
>
> Merci.
>
> Laurent.
>
>------------------------------------------------------------------------
>
>_______________________________________________
>Dcmlib mailing list
>Dcmlib at creatis.insa-lyon.fr
>http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/dcmlib
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