<br>Hi Michal, <br><br>Maybe you are refering to a static compilation? ..<br>You can have a look at this page created by Simon.<br><a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv-static">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv-static</a><br>
<br>Regards<br>bharath<br><br><br><div class="gmail_quote">On Mon, Feb 14, 2011 at 2:06 PM,  <span dir="ltr"><<a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a>></span> wrote:<br>
<blockquote class="gmail_quote" style="margin: 0pt 0pt 0pt 0.8ex; border-left: 1px solid rgb(204, 204, 204); padding-left: 1ex;">
Send vv mailing list submissions to<br>
        <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
<br>
To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
        <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
        <a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
<br>
You can reach the person managing the list at<br>
        <a href="mailto:vv-owner@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-owner@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
<br>
When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
than "Re: Contents of vv digest..."<br>
<br>
<br>
Today's Topics:<br>
<br>
   1. Re: vv Digest, Vol 11, Issue 6 (bharath)<br>
   2. Re: vv Digest, Vol 11, Issue 6 (Bc. Michal Srna)<br>
<br>
<br>
----------------------------------------------------------------------<br>
<br>
Message: 1<br>
Date: Mon, 14 Feb 2011 13:55:48 +0100<br>
From: bharath <<a href="mailto:nkbharath@gmail.com" target="_blank">nkbharath@gmail.com</a>><br>
To: <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
Subject: Re: [Vv] vv Digest, Vol 11, Issue 6<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:AANLkTinGVnujWtzcRo4yL9kJh8UgU8xvknNuQ60s6kpk@mail.gmail.com" target="_blank">AANLkTinGVnujWtzcRo4yL9kJh8UgU8xvknNuQ60s6kpk@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Hi VVusers!,<br>
<br>
Nice to come back to vv !..<br>
<br>
to answer Michal questions, here are a few possible pointers that  may work<br>
regarding your errors in MSVC.<br>
<br>
1) for the error "please convert the source file to either DOS or UNIX<br>
format"<br>
You could try to convert the line endings to Windows CR LF or Macintosh(i<br>
dont remember which one worked!). from File->Advanced Save Options->LIne<br>
Endings.<br>
<br>
2) for the  error on "clitkAffineRegistrationLib" , you could turn off<br>
Registration option off in the cmake gui and then recompile.<br>
<br>
3)  for "fatal error LNK1181: cannot open input file 'ITKAlgorithms.lib'",<br>
make sure you compiled ITK in the same configuration as<br>
with VV. I think you compiled ITK in Debug, and hence clitk works with Debug<br>
configuation. Make sure you compile ITK in Release to<br>
supress the error.<br>
alternatively  you may want to have a look at this<br>
link..<a href="http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2007-March/021248.html" target="_blank">http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2007-March/021248.html</a><br>
<br>
4)for  fatal error C1128: number of sections exceeded object file format<br>
limit : compile with /bigobj. Try including this option /bigobj in Project<br>
properties->C++ ->Linker settings ->Command line ...<br>
Hope this helps..<br>
<br>
Regards<br>
Bharath<br>
<br>
<br>
Regarding the r<br>
On Mon, Feb 14, 2011 at 12:00 PM, <<a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a>> wrote:<br>
<br>
> Send vv mailing list submissions to<br>
>        <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
><br>
> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>        <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>        <a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
><br>
> You can reach the person managing the list at<br>
>        <a href="mailto:vv-owner@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-owner@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
><br>
> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
> than "Re: Contents of vv digest..."<br>
><br>
><br>
> Today's Topics:<br>
><br>
>   1. Compiling src of VV - almost successful (Michal Srna)<br>
>   2. Re: Compiling src of VV - almost successful (David Sarrut)<br>
><br>
><br>
> ----------------------------------------------------------------------<br>
><br>
> Message: 1<br>
> Date: Sun, 13 Feb 2011 14:07:24 +0100<br>
> From: Michal Srna <<a href="mailto:michal@srna.info" target="_blank">michal@srna.info</a>><br>
> To: <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
> Subject: [Vv] Compiling src of VV - almost successful<br>
> Message-ID: <<a href="mailto:4D57D78C.2090907@srna.info" target="_blank">4D57D78C.2090907@srna.info</a>><br>
> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-2; format=flowed<br>
><br>
> Hello,<br>
><br>
> I have compiled/installed and prepared all prerequisites needed for VV<br>
> compilation from src (Qt, VTK, ITK, Gengetopt) step by step described on<br>
> VV web. I am on Windows 7 (64b) with MSVC++ 2008 Express Edition.<br>
><br>
> Now I have 3 questions and it will really help me, if someone could<br>
> answer me:<br>
><br>
> 1) When I download src zip file from this site<br>
><br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gz" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gz</a><br>


> and run CMake it says me, that Gengetopt is not installed (but I have<br>
> installed it, I also tried to add it in PATH) - so I manually select<br>
> path to the X:\GnuWin32\bin (is it OK?) and run Generate in CMake.<br>
><br>
> Then I open generated solution in my MSVC++ and everything is OK, I will<br>
> select Debug mode and build the solution (F7) -> it will create .exe<br>
> file and I can run VV (works like a charm).<br>
><br>
> But when I select Release mode (in Solution Configurations), it will<br>
> write one error at the end of building: "fatal error LNK1181: cannot<br>
> open input file 'ITKAlgorithms.lib'". I don't know, what am I doing<br>
> wrong... maybe I can not use Release mode for VV building and I need to<br>
> use only Debug?<br>
><br>
> 2) When I downloaded src from CVS (clitk3) and did everything same as in<br>
> step 1) (where I used src from zip file), it will build no vv.exe file<br>
> and it will write 2 errors in part of building vv project:<br>
><br>
> itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
> detected: please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
><br>
> itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
> detected: please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
><br>
> I will get also one more error in part of bulding<br>
> clitkAffineRegistrationLib, the error is:<br>
><br>
> c:\program files (x86)\microsoft visual studio<br>
> 9.0\vc\include\vector(1261) : fatal error C1128: number of sections<br>
> exceeded object file format limit : compile with /bigobj<br>
><br>
> Could it be the problem, that I am doing it on files from CVS - I<br>
> downloaded whole folder clitk3? Should I use only vvSource-1.1.tar.gz<br>
> file, which works for me?<br>
><br>
> 3) I would like to make some changes in the code - is it better to do<br>
> that directly in src files (for example directly open the .cxx file I<br>
> need to change) or can I make these changes in Solution, which was<br>
> generated by CMake after I opened it in my MSVC++?<br>
><br>
> Thanks for answer on my questions!<br>
><br>
><br>
> --<br>
> S pozdravem Bc. Michal Srna<br>
><br>
> Fotografick? portfolio:<br>
> <a href="http://michalsrna.cz" target="_blank">http://michalsrna.cz</a><br>
><br>
><br>
><br>
> ------------------------------<br>
><br>
> Message: 2<br>
> Date: Mon, 14 Feb 2011 08:17:00 +0100<br>
> From: David Sarrut <<a href="mailto:David.Sarrut@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">David.Sarrut@creatis.insa-lyon.fr</a>><br>
> To: vv <<a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a>><br>
> Subject: Re: [Vv] Compiling src of VV - almost successful<br>
> Message-ID:<br>
>        <<a href="mailto:AANLkTinjn381vJKg4AdaJeC%2BKJ3s%2BNE7-MGvvrUOCYO6@mail.gmail.com" target="_blank">AANLkTinjn381vJKg4AdaJeC+KJ3s+NE7-MGvvrUOCYO6@mail.gmail.com</a>><br>
> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
><br>
> Hello Michal,<br>
><br>
> first, thanks for you interest in VV !<br>
><br>
> Our Windows specialist is not here until few weeks, so I am afraid that you<br>
> will have few replies regarding Windows issues.<br>
><br>
> Regarding the landmarks, we decided to use mm because it remains usable<br>
> even<br>
> if you display the landmarks on a resampled image. It is generally a better<br>
> way to express coordinates in mm rather in pixels. I think it is important<br>
> to not change this behavior. However, we can anyway include pixel<br>
> coordinates as additional columns when writing the landmarks file. It also<br>
> requires that those additional columns are ignored when importing a set of<br>
> landmarks. Is that ok for you ?<br>
><br>
> The next VV version will probably be released in few weeks/months, so<br>
> I suggest that you continue to try the cvs version. If you manage to<br>
> compile<br>
> (I am sure you will with help of others people in the list), it will then<br>
> be<br>
> easy for you to update the cvs.<br>
><br>
> Sincerely,<br>
> David<br>
><br>
> On Sun, Feb 13, 2011 at 2:07 PM, Michal Srna <<a href="mailto:michal@srna.info" target="_blank">michal@srna.info</a>> wrote:<br>
><br>
> > Hello,<br>
> ><br>
> > I have compiled/installed and prepared all prerequisites needed for VV<br>
> > compilation from src (Qt, VTK, ITK, Gengetopt) step by step described on<br>
> VV<br>
> > web. I am on Windows 7 (64b) with MSVC++ 2008 Express Edition.<br>
> ><br>
> > Now I have 3 questions and it will really help me, if someone could<br>
> answer<br>
> > me:<br>
> ><br>
> > 1) When I download src zip file from this site<br>
> ><br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gzandrun" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gzandrun</a> CMake it says me, that Gengetopt is not installed (but I have<br>


> > installed it, I also tried to add it in PATH) - so I manually select path<br>
> to<br>
> > the X:\GnuWin32\bin (is it OK?) and run Generate in CMake.<br>
> ><br>
> > Then I open generated solution in my MSVC++ and everything is OK, I will<br>
> > select Debug mode and build the solution (F7) -> it will create .exe file<br>
> > and I can run VV (works like a charm).<br>
> ><br>
> > But when I select Release mode (in Solution Configurations), it will<br>
> write<br>
> > one error at the end of building: "fatal error LNK1181: cannot open input<br>
> > file 'ITKAlgorithms.lib'". I don't know, what am I doing wrong... maybe I<br>
> > can not use Release mode for VV building and I need to use only Debug?<br>
> ><br>
> > 2) When I downloaded src from CVS (clitk3) and did everything same as in<br>
> > step 1) (where I used src from zip file), it will build no vv.exe file<br>
> and<br>
> > it will write 2 errors in part of building vv project:<br>
> ><br>
> > itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format detected:<br>
> > please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
> ><br>
> > itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format detected:<br>
> > please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
> ><br>
> > I will get also one more error in part of bulding<br>
> > clitkAffineRegistrationLib, the error is:<br>
> ><br>
> > c:\program files (x86)\microsoft visual studio<br>
> 9.0\vc\include\vector(1261)<br>
> > : fatal error C1128: number of sections exceeded object file format limit<br>
> :<br>
> > compile with /bigobj<br>
> ><br>
> > Could it be the problem, that I am doing it on files from CVS - I<br>
> > downloaded whole folder clitk3? Should I use only vvSource-1.1.tar.gz<br>
> file,<br>
> > which works for me?<br>
> ><br>
> > 3) I would like to make some changes in the code - is it better to do<br>
> that<br>
> > directly in src files (for example directly open the .cxx file I need to<br>
> > change) or can I make these changes in Solution, which was generated by<br>
> > CMake after I opened it in my MSVC++?<br>
> ><br>
> > Thanks for answer on my questions!<br>
> ><br>
> ><br>
> > --<br>
> > S pozdravem Bc. Michal Srna<br>
> ><br>
> > Fotografick? portfolio:<br>
> > <a href="http://michalsrna.cz" target="_blank">http://michalsrna.cz</a><br>
> ><br>
> > _______________________________________________<br>
> > vv mailing list<br>
> > <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
> > <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
> ><br>
><br>
><br>
><br>
> --<br>
> David Sarrut, Phd<br>
> Charg? de recherche CNRS<br>
> Laboratoire CREATIS, UMR CNRS 5220, Inserm U 1044<br>
> Centre de lutte contre le cancer L?on B?rard<br>
> 28 rue La?nnec, 69373 Lyon cedex 08<br>
> Tel : 04 78 78 51 51 / 06 74 72 05 42<br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio</a><br>
> _________________________________<br>
>  "2 + 2 = 5,  for extremely large values of 2"<br>
> _________________________________<br>
> -------------- next part --------------<br>
> An HTML attachment was scrubbed...<br>
> URL: <<br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/0808a082/attachment-0001.html" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/0808a082/attachment-0001.html</a><br>


> ><br>
><br>
> ------------------------------<br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> vv mailing list<br>
> <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
><br>
><br>
> End of vv Digest, Vol 11, Issue 6<br>
> *********************************<br>
><br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/371f6352/attachment-0001.html" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/371f6352/attachment-0001.html</a>><br>


<br>
------------------------------<br>
<br>
Message: 2<br>
Date: Mon, 14 Feb 2011 14:06:39 +0100<br>
From: "Bc. Michal Srna" <<a href="mailto:michal@srna.info" target="_blank">michal@srna.info</a>><br>
To: <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
Subject: Re: [Vv] vv Digest, Vol 11, Issue 6<br>
Message-ID:<br>
        <<a href="mailto:AANLkTimxgQbH5Up8DbkN3fiYz7Wf102H%2Bpa1dfUjyivY@mail.gmail.com" target="_blank">AANLkTimxgQbH5Up8DbkN3fiYz7Wf102H+pa1dfUjyivY@mail.gmail.com</a>><br>
Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
<br>
Thanks a lot! I will try.<br>
<br>
I have one last question - I tried to run my build of vv.exe on another PC<br>
and it wrote error when starting, that some dll's from Qt are missing. On my<br>
PC it works well, because I have those dll's in system var PATH.<br>
<br>
I didn't figure out, how to include those dll's into .exe file, so it would<br>
be standalone .exe - not depended on other dll's. Maybe some setting in<br>
MSVC++?<br>
<br>
Thanks!<br>
<br>
2011/2/14 bharath <<a href="mailto:nkbharath@gmail.com" target="_blank">nkbharath@gmail.com</a>><br>
<br>
> Hi VVusers!,<br>
><br>
> Nice to come back to vv !..<br>
><br>
> to answer Michal questions, here are a few possible pointers that  may work<br>
> regarding your errors in MSVC.<br>
><br>
> 1) for the error "please convert the source file to either DOS or UNIX<br>
> format"<br>
> You could try to convert the line endings to Windows CR LF or Macintosh(i<br>
> dont remember which one worked!). from File->Advanced Save Options->LIne<br>
> Endings.<br>
><br>
> 2) for the  error on "clitkAffineRegistrationLib" , you could turn off<br>
> Registration option off in the cmake gui and then recompile.<br>
><br>
> 3)  for "fatal error LNK1181: cannot open input file 'ITKAlgorithms.lib'",<br>
> make sure you compiled ITK in the same configuration as<br>
> with VV. I think you compiled ITK in Debug, and hence clitk works with<br>
> Debug configuation. Make sure you compile ITK in Release to<br>
> supress the error.<br>
> alternatively  you may want to have a look at this link..<a href="http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2007-March/021248.html" target="_blank">http://www.itk.org/pipermail/insight-users/2007-March/021248.html</a><br>


><br>
> 4)for  fatal error C1128: number of sections exceeded object file format<br>
> limit : compile with /bigobj. Try including this option /bigobj in Project<br>
> properties->C++ ->Linker settings ->Command line ...<br>
> Hope this helps..<br>
><br>
> Regards<br>
> Bharath<br>
><br>
><br>
> Regarding the r<br>
> On Mon, Feb 14, 2011 at 12:00 PM, <<a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a>> wrote:<br>
><br>
>> Send vv mailing list submissions to<br>
>>        <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>><br>
>> To subscribe or unsubscribe via the World Wide Web, visit<br>
>>        <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
>> or, via email, send a message with subject or body 'help' to<br>
>>        <a href="mailto:vv-request@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-request@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>><br>
>> You can reach the person managing the list at<br>
>>        <a href="mailto:vv-owner@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv-owner@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>><br>
>> When replying, please edit your Subject line so it is more specific<br>
>> than "Re: Contents of vv digest..."<br>
>><br>
>><br>
>> Today's Topics:<br>
>><br>
>>   1. Compiling src of VV - almost successful (Michal Srna)<br>
>>   2. Re: Compiling src of VV - almost successful (David Sarrut)<br>
>><br>
>><br>
>> ----------------------------------------------------------------------<br>
>><br>
>> Message: 1<br>
>> Date: Sun, 13 Feb 2011 14:07:24 +0100<br>
>> From: Michal Srna <<a href="mailto:michal@srna.info" target="_blank">michal@srna.info</a>><br>
>> To: <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>> Subject: [Vv] Compiling src of VV - almost successful<br>
>> Message-ID: <<a href="mailto:4D57D78C.2090907@srna.info" target="_blank">4D57D78C.2090907@srna.info</a>><br>
>> Content-Type: text/plain; charset=ISO-8859-2; format=flowed<br>
>><br>
>> Hello,<br>
>><br>
>> I have compiled/installed and prepared all prerequisites needed for VV<br>
>> compilation from src (Qt, VTK, ITK, Gengetopt) step by step described on<br>
>> VV web. I am on Windows 7 (64b) with MSVC++ 2008 Express Edition.<br>
>><br>
>> Now I have 3 questions and it will really help me, if someone could<br>
>> answer me:<br>
>><br>
>> 1) When I download src zip file from this site<br>
>><br>
>> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gz" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gz</a><br>


>> and run CMake it says me, that Gengetopt is not installed (but I have<br>
>> installed it, I also tried to add it in PATH) - so I manually select<br>
>> path to the X:\GnuWin32\bin (is it OK?) and run Generate in CMake.<br>
>><br>
>> Then I open generated solution in my MSVC++ and everything is OK, I will<br>
>> select Debug mode and build the solution (F7) -> it will create .exe<br>
>> file and I can run VV (works like a charm).<br>
>><br>
>> But when I select Release mode (in Solution Configurations), it will<br>
>> write one error at the end of building: "fatal error LNK1181: cannot<br>
>> open input file 'ITKAlgorithms.lib'". I don't know, what am I doing<br>
>> wrong... maybe I can not use Release mode for VV building and I need to<br>
>> use only Debug?<br>
>><br>
>> 2) When I downloaded src from CVS (clitk3) and did everything same as in<br>
>> step 1) (where I used src from zip file), it will build no vv.exe file<br>
>> and it will write 2 errors in part of building vv project:<br>
>><br>
>> itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
>> detected: please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
>><br>
>> itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
>> detected: please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
>><br>
>> I will get also one more error in part of bulding<br>
>> clitkAffineRegistrationLib, the error is:<br>
>><br>
>> c:\program files (x86)\microsoft visual studio<br>
>> 9.0\vc\include\vector(1261) : fatal error C1128: number of sections<br>
>> exceeded object file format limit : compile with /bigobj<br>
>><br>
>> Could it be the problem, that I am doing it on files from CVS - I<br>
>> downloaded whole folder clitk3? Should I use only vvSource-1.1.tar.gz<br>
>> file, which works for me?<br>
>><br>
>> 3) I would like to make some changes in the code - is it better to do<br>
>> that directly in src files (for example directly open the .cxx file I<br>
>> need to change) or can I make these changes in Solution, which was<br>
>> generated by CMake after I opened it in my MSVC++?<br>
>><br>
>> Thanks for answer on my questions!<br>
>><br>
>><br>
>> --<br>
>> S pozdravem Bc. Michal Srna<br>
>><br>
>> Fotografick? portfolio:<br>
>> <a href="http://michalsrna.cz" target="_blank">http://michalsrna.cz</a><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> ------------------------------<br>
>><br>
>> Message: 2<br>
>> Date: Mon, 14 Feb 2011 08:17:00 +0100<br>
>> From: David Sarrut <<a href="mailto:David.Sarrut@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">David.Sarrut@creatis.insa-lyon.fr</a>><br>
>> To: vv <<a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a>><br>
>> Subject: Re: [Vv] Compiling src of VV - almost successful<br>
>> Message-ID:<br>
>>        <<a href="mailto:AANLkTinjn381vJKg4AdaJeC%2BKJ3s%2BNE7-MGvvrUOCYO6@mail.gmail.com" target="_blank">AANLkTinjn381vJKg4AdaJeC+KJ3s+NE7-MGvvrUOCYO6@mail.gmail.com</a>><br>
>> Content-Type: text/plain; charset="iso-8859-1"<br>
>><br>
>> Hello Michal,<br>
>><br>
>> first, thanks for you interest in VV !<br>
>><br>
>> Our Windows specialist is not here until few weeks, so I am afraid that<br>
>> you<br>
>> will have few replies regarding Windows issues.<br>
>><br>
>> Regarding the landmarks, we decided to use mm because it remains usable<br>
>> even<br>
>> if you display the landmarks on a resampled image. It is generally a<br>
>> better<br>
>> way to express coordinates in mm rather in pixels. I think it is important<br>
>> to not change this behavior. However, we can anyway include pixel<br>
>> coordinates as additional columns when writing the landmarks file. It also<br>
>> requires that those additional columns are ignored when importing a set of<br>
>> landmarks. Is that ok for you ?<br>
>><br>
>> The next VV version will probably be released in few weeks/months, so<br>
>> I suggest that you continue to try the cvs version. If you manage to<br>
>> compile<br>
>> (I am sure you will with help of others people in the list), it will then<br>
>> be<br>
>> easy for you to update the cvs.<br>
>><br>
>> Sincerely,<br>
>> David<br>
>><br>
>> On Sun, Feb 13, 2011 at 2:07 PM, Michal Srna <<a href="mailto:michal@srna.info" target="_blank">michal@srna.info</a>> wrote:<br>
>><br>
>> > Hello,<br>
>> ><br>
>> > I have compiled/installed and prepared all prerequisites needed for VV<br>
>> > compilation from src (Qt, VTK, ITK, Gengetopt) step by step described on<br>
>> VV<br>
>> > web. I am on Windows 7 (64b) with MSVC++ 2008 Express Edition.<br>
>> ><br>
>> > Now I have 3 questions and it will really help me, if someone could<br>
>> answer<br>
>> > me:<br>
>> ><br>
>> > 1) When I download src zip file from this site<br>
>> ><br>
>> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gzandrun" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio/vv?action=AttachFile&do=view&target=vvSource-1.1.tar.gzandrun</a> CMake it says me, that Gengetopt is not installed (but I have<br>


>> > installed it, I also tried to add it in PATH) - so I manually select<br>
>> path to<br>
>> > the X:\GnuWin32\bin (is it OK?) and run Generate in CMake.<br>
>> ><br>
>> > Then I open generated solution in my MSVC++ and everything is OK, I will<br>
>> > select Debug mode and build the solution (F7) -> it will create .exe<br>
>> file<br>
>> > and I can run VV (works like a charm).<br>
>> ><br>
>> > But when I select Release mode (in Solution Configurations), it will<br>
>> write<br>
>> > one error at the end of building: "fatal error LNK1181: cannot open<br>
>> input<br>
>> > file 'ITKAlgorithms.lib'". I don't know, what am I doing wrong... maybe<br>
>> I<br>
>> > can not use Release mode for VV building and I need to use only Debug?<br>
>> ><br>
>> > 2) When I downloaded src from CVS (clitk3) and did everything same as in<br>
>> > step 1) (where I used src from zip file), it will build no vv.exe file<br>
>> and<br>
>> > it will write 2 errors in part of building vv project:<br>
>> ><br>
>> > itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
>> detected:<br>
>> > please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
>> ><br>
>> > itkBinaryThinningImageFilter3D.h : error C4335: Mac file format<br>
>> detected:<br>
>> > please convert the source file to either DOS or UNIX format<br>
>> ><br>
>> > I will get also one more error in part of bulding<br>
>> > clitkAffineRegistrationLib, the error is:<br>
>> ><br>
>> > c:\program files (x86)\microsoft visual studio<br>
>> 9.0\vc\include\vector(1261)<br>
>> > : fatal error C1128: number of sections exceeded object file format<br>
>> limit :<br>
>> > compile with /bigobj<br>
>> ><br>
>> > Could it be the problem, that I am doing it on files from CVS - I<br>
>> > downloaded whole folder clitk3? Should I use only vvSource-1.1.tar.gz<br>
>> file,<br>
>> > which works for me?<br>
>> ><br>
>> > 3) I would like to make some changes in the code - is it better to do<br>
>> that<br>
>> > directly in src files (for example directly open the .cxx file I need to<br>
>> > change) or can I make these changes in Solution, which was generated by<br>
>> > CMake after I opened it in my MSVC++?<br>
>> ><br>
>> > Thanks for answer on my questions!<br>
>> ><br>
>> ><br>
>> > --<br>
>> > S pozdravem Bc. Michal Srna<br>
>> ><br>
>> > Fotografick? portfolio:<br>
>> > <a href="http://michalsrna.cz" target="_blank">http://michalsrna.cz</a><br>
>> ><br>
>> > _______________________________________________<br>
>> > vv mailing list<br>
>> > <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>> > <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
>> ><br>
>><br>
>><br>
>><br>
>> --<br>
>> David Sarrut, Phd<br>
>> Charg? de recherche CNRS<br>
>> Laboratoire CREATIS, UMR CNRS 5220, Inserm U 1044<br>
>> Centre de lutte contre le cancer L?on B?rard<br>
>> 28 rue La?nnec, 69373 Lyon cedex 08<br>
>> Tel : 04 78 78 51 51 / 06 74 72 05 42<br>
>> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/rio</a><br>
>> _________________________________<br>
>>  "2 + 2 = 5,  for extremely large values of 2"<br>
>> _________________________________<br>
>> -------------- next part --------------<br>
>> An HTML attachment was scrubbed...<br>
>> URL: <<br>
>> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/0808a082/attachment-0001.html" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/0808a082/attachment-0001.html</a><br>


>> ><br>
>><br>
>> ------------------------------<br>
>><br>
>> _______________________________________________<br>
>> vv mailing list<br>
>> <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
>> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
>><br>
>><br>
>> End of vv Digest, Vol 11, Issue 6<br>
>> *********************************<br>
>><br>
><br>
><br>
> _______________________________________________<br>
> vv mailing list<br>
> <a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
> <a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
><br>
><br>
<br>
<br>
--<br>
S pozdravem Bc. Michal Srna<br>
<br>
Fotografick? portfolio:<br>
<a href="http://michalsrna.cz" target="_blank">http://michalsrna.cz</a><br>
-------------- next part --------------<br>
An HTML attachment was scrubbed...<br>
URL: <<a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/07188107/attachment.html" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/pipermail/vv/attachments/20110214/07188107/attachment.html</a>><br>


<br>
------------------------------<br>
<br>
_______________________________________________<br>
vv mailing list<br>
<a href="mailto:vv@creatis.insa-lyon.fr" target="_blank">vv@creatis.insa-lyon.fr</a><br>
<a href="http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv" target="_blank">http://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/vv</a><br>
<br>
<br>
End of vv Digest, Vol 11, Issue 7<br>
*********************************<br>
</blockquote></div><br>