<div dir="ltr"><div>Hi,</div><div>Sorry for my late reply. </div><div>1. The Hann parameter is a fraction of the Nyquist frequency. If set to 0, there is no Hann windowing. If you set it to 0.5, a Hann windowing is used with a cut-off at 50% of the Nyquist frequency.</div><div>2. The reconstructed values are attenuation coefficient assuming that the input projections are line integrals of this coefficient. Small values are typical, yes. For HU conversion, you need to normalize them using the attenuation coefficient of air and water.</div><div>3. For denoising, you could use the <a href="http://www.openrtk.org/Doxygen/classrtk_1_1TotalVariationDenoisingBPDQImageFilter.html">TV denoiser</a> but there are probably other options in ITK (e.g., Gaussian smoothing). For scatter, we only have the <a href="http://www.openrtk.org/Doxygen/classrtk_1_1BoellaardScatterCorrectionImageFilter.html">Boellaard algorithm</a>. For binarizing, you can threshold your image.</div><div>Simon<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Sun, Oct 29, 2023 at 11:23 AM 小哈 <<a href="mailto:2310447681@qq.com">2310447681@qq.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex"><div><div>Hello, </div><div>I think RTK packets are very useful in reconstructing CBCT. When using the FDK algorithm with RTK packets, I encountered the following issues:</div><div>1.How should I set the parameters if I want to achieve a truncation frequency of 5 for reconstruction? What is the function of the Hann parameter?</div><div>2. For the reconstructed 3D image in mha format (512 * 256 * 512), I use simpleITK to read the code as follows:</div><div><br></div><div>Image=sitk ReadImage (path)</div><div>Vol=sitk GetArrayFromImage (image)</div><div><br></div><div>But the obtained three-dimensional array vol, but each value in the array is very small, is this normal? The results of the array are shown in the figure:</div></div><div><img src="cid:ii_18ba93db10c423524761" id="m_2000235277151751190img_insert_169857450024008576297642390456"><br>3. If I want to further denoise, scatter correct, and binarize the reconstructed image, how should I achieve it？</div><div>If you could help me, I would be very grateful. Thank you.<br><br></div>_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:rtk-users@openrtk.org" target="_blank">rtk-users@openrtk.org</a><br>
<a href="https://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
</blockquote></div>