<div dir="ltr"><div>Hi Albert,</div><div>Nice to hear that you are still working on CT. There are two things that must be accounted for</div><div>- there is a difference in convention for the rotation angle between gVirtualXRay and RTK,</div><div>- the projections are not centered if the origin is 0.</div><div>The following command lines work for me:</div><div><span style="font-family:monospace">rtksimulatedgeometry -n 360 -a -360 -o g  --sdd 1000 --sid 500<br>rtkfdk -p . -r 'projection([0-9]*).tif' -o fdk.mha --neworigin -159.75,-119.75,0 --newspacing 0.5 --nsort --submatch 1 --hardware cuda -g g</span></div>Let me know if something is unclear,<div>Simon<br></div></div><br><div class="gmail_quote"><div dir="ltr" class="gmail_attr">On Wed, Jun 21, 2023 at 10:04 AM Albert MURIENNE <<a href="mailto:Albert.MURIENNE@b-com.com">Albert.MURIENNE@b-com.com</a>> wrote:<br></div><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left:1px solid rgb(204,204,204);padding-left:1ex">Hello,<br>
<br>
I'm struggling to reconstruct properly a synthetic projection images sequence using RTK.<br>
The sequence was generated using gVirtualXRay (<a href="https://gvirtualxray.fpvidal.net/" rel="noreferrer" target="_blank">https://gvirtualxray.fpvidal.net/</a>) and a dragon 3D model, and represents a full 360 degrees CBCT tomographic sequence, with a 500mm SID and 1000mm SDD, 0.5mm pixel size with a 640x480 image resolution, and without any offsets (perfect circular geometry). I tried reconstructions with the simplest FDK and SART implementations, inspired by RTK provided code examples, using rtk::ProjectionsReader to read the images and rtk::ThreeDCircularProjectionGeometry to read the geometry, but the results are not good, and I don't really know if the problem comes from the data or from my reconstruction implementation.<br>
<br>
The images data, as well as the xml geometry I generated, are available for download at this link:<br>
<br>
<a href="https://filesender.renater.fr/?s=download&token=bc8f87b4-989c-46d7-8c4b-dac39a4df0e1" rel="noreferrer" target="_blank">https://filesender.renater.fr/?s=download&token=bc8f87b4-989c-46d7-8c4b-dac39a4df0e1</a><br>
<br>
Could you help me pinpoint the origin of my problem? Does it come from the data itself?<br>
<br>
Thanks,<br>
<br>
Albert<br>
Murienne <br>
<br>
_______________________________________________<br>
Rtk-users mailing list<br>
<a href="mailto:rtk-users@openrtk.org" target="_blank">rtk-users@openrtk.org</a><br>
<a href="https://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/rtk-users" rel="noreferrer" target="_blank">https://www.creatis.insa-lyon.fr/mailman/listinfo/rtk-users</a><br>
</blockquote></div>